Recordemos que una instalación limpia de Ubuntu nos deja las carpetas de Sistema en el /HOME esto no siempre es lo que necesitamos al momento de personalizar nuestro sistema.

Solo necesitamos editar un archivo de texto para poder tener configurados a nuestro gusto las Carpetas de tu Sistema en Gnome, esto es de mucha ayuda cuando tenemos particiones de Datos en las cuales guardamos nuestros Documentos, Música, Vídeos etc.

Edita el archivo:

sudo gedit ~/.config/user-dirs.dirs

No esta de más decir que debes de tener cuidado al momento de escribir las direcciones de tus carpetas para evitar problemas.